Le projet de coopération transfrontalière de l’Eurocité Basque Bayonne – San Sebastián est né le 18 janvier 1993 lorsque Henri Grenet, Président du District Bayonne – Anglet  - Biarritz et Eli Galdos, Député général de la Diputación Foral de Gipuzkoa signèrent un protocole de coopération transfrontalière.

Il se fonde sur un espace, qui est un territoire transfrontalier et un vrai « continuum urbain » avec :

• un PIB supérieur à la moyenne européenne,
• une localisation stratégique au niveau européen sur la façade atlantique,
• un potentiel scientifique significatif et des ressources humaines de qualité liées au tissu productif,
• une offre culturelle et de loisirs très variée et un tourisme reconnu sur le plan international.

Son objectif est de transformer une réalité urbaine qui s’étend sur 50 km de long entre Bayonne et San Sebastián, à ce jour simple juxtaposition de structures administratives différentes, en une nouvelle métropole européenne de 600 000 habitants au sein de laquelle les infrastructures, les services urbains et les instruments de gouvernement seraient conçus de façon conjointe.

En juin 1998, l’Agence transfrontalière lance un processus de réflexion stratégique visant à construire une métropole au cœur du système urbain européen et atlantique. Cette réflexion stratégique interactive aboutit en juin 2000 à la rédaction du Livre Blanc de l’Eurocité Basque  dont les trois grands objectifs sont :

• constituer la plateforme atlantique d’inter-modalité, de communication et d’information, en transformant l’actuel corridor, de transit en Euro-corridor de développement,
• structurer une métropole linéaire poly-centrée en réseau, à travers la mise en pratique d’une maîtrise de l’espace, des infrastructures et une offre de services et d’équipements ayant un niveau d’articulation et de qualité qui réponde aux exigences de métropoles de rang européen,
• protéger et valoriser le patrimoine naturel, à travers l’excellence environnementale appliquée au concept de « métropole verte ».

Par ailleurs, l’Agence a lancé différentes commissions sectorielles (environnement, culture, tourisme, services sociaux, synergie dans le tissu économique, sports, observatoire du logement et de l’habitat, observatoire de santé publique).
Parmi les actions réalisées dans ce cadre, on peut citer :

• l’organisation de congrès transfrontaliers pour les jeunes sur l’environnement,
• l’élaboration de la charte environnementale de l’Eurocité,
• la rédaction de divers guides et publications : guide des équipements environnementaux, guide du sport, guide trilingue « A portée de main » sur les 3 langues de l’Eurocité, guide de l’enseignement supérieur, guide de l’organisation administrative de l’Eurocité…

En 2008, l’Agence transfrontalière recentre son action sur deux principaux axes stratégiques :

Le développement durable et la mobilité.

• En matière de développement durable, l’Agence a lancé le projet de réseau vert et bleu de l’Eurocité basque (REDVERT) .
• En matière de mobilité, l’Agence a réalisé des études visant à développer un transport ferroviaire cadencé et sans rupture de charge entre Bayonne et San Sebastián (Eurocité Express).