Cada año, la Agencia transfronteriza apoya la realización de proyectos transfronterizos en el territorio de la Eurociudad Vasca a través de patrocinios.
Para ser patrocinados, los proyectos deben cumplir con los siguientes criterios:
- Disponibilidad de crédito (votación en la Asamblea General anual de la Agencia transfronteriza)
- Carácter transfronteriza bilateral del proyecto (en la formación o ejecución)
- Finalización del proyecto a más tardar en el primer trimestre del año siguiente a la asignación de la ayuda.
- Promotores de proyectos (personas físicas y jurídicas) que residan en la Eurociudad Vasca.
- Proyecto financiado por la Agencia transfronteriza un máximo de 2 veces.
- Dossier completo (incluyendo un plan descriptivo detallado, el presupuesto y un plan de financiación incluyendo las ayudas solicitadas y la definición de las acciones acordes con las áreas estratégicas de la Eurociudad Vasca).
En 2013 y 2014, se han patrocinado dos proyectos:
- Marcha cicloturista de la Eurociudad Vasca organizada por el club Bera Bera y el Aviron de Bayona en 2013 y 2014.
- Conferencia/Coloquio sobre el empleo transfronterizo de los jóvenes en el País Vasco Norte y en el Sur "Trabajar en el País Vasco: misión imposible", organizado por los alumnos del Master transfronterizo de la universidad UPPA del campus de Bayona en abril de 2014.